RiboCrypt

DOI:10.18129 / B9.bioc.RiboCrypt

这是发展RiboCrypt版本;稳定版请参见RiboCrypt．

基因组学的交互式可视化

Bioconductor版本:开发(3.16)

用于交互式可视化和浏览NGS数据的R包。它包含一个文本和基因组坐标视图的浏览器。此外，还包括QC和一般元图，以及微分翻译图和基因表达图。该软件包仍在开发中。

作者:Michal Swirski [aut, cre]， Haakon Tjeldnes [ctb]

维护者:Michal Swirski < Michal。在uw.edu.pl>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("RiboCrypt")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RiboCrypt”)

超文本标记语言	R脚本	RiboCrypt_overview.html
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	RNASeq，RiboSeq，测序，软件
版本	1.3.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)，ORFik(> = 1.13.12)
进口	BiocGenerics，BiocParallel，Biostrings，data.table，dplyr，GenomeInfoDb，GenomicFeatures，GenomicRanges，ggplot2，IRanges，情节，rlang
链接
建议	testthat，rmarkdown，knitr，BiocStyle，BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/m-swirski/RiboCrypt
BugReports	https://github.com/m-swirski/RiboCrypt/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	RiboCrypt_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	RiboCrypt_1.3.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	RiboCrypt_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RiboCrypt
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RiboCrypt
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RiboCrypt/
软件包下载报告	下载数据