redseq

doi：10.18129/b9.bioc.redseq

这是发展Redseq的版本;对于稳定版本，请参阅redseq。

通过限制酶消化处理的高通量测序数据分析

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包包括构建限制酶切割位点（REC）地图的功能，使用五种不同的方法在地图上分布映射的序列，为样品找到富集/耗尽的REC，并识别样品之间的差异丰富/耗尽的REC。

作者：Lihua Julie Zhu，Junhui Li和Thomas Fazzio

维护者：Lihua Julie Zhu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ redseq”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ redseq”）

PDF	R脚本	Redseq小插图
PDF		参考手册

细节

生物浏览	预处理，，，，测序，，，，测序，，，，软件
版本	1.43.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（10。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.5.0），生物基因，，，，bsgenome.celegans.ucsc.ce2，，，，多检验，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，Chippeakanno
进口	AnnotationDbi，图形，iranges（> = 1.13.5），统计，utils
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	redseq_1.43.0.tar.gz
Windows二进制	redseq_1.43.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	redseq_1.43.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/redseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/redseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/redseq/
软件包下载报告	下载统计