米尼卡

doi：10.18129/b9.bioc.mineica

这是发展Mineica的版本；对于稳定版本，请参阅米尼卡。

对基因组数据获得的ICA分解的分析

生物导体版本：开发（3.16）

Mineica的目的是在多个转录组数据集上执行独立的组件分析（ICA），并集成其他数据（例如分子，临床和病理）。这种集成的ICA通过研究其与变量（例如样品注释）和基因集的关联来帮助对组件的生物学解释，并可以使用基于相关的图进行比较来自不同数据集的组件。

作者：安妮·比顿

维护者：Anne Biton

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ mineica”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Mineica”）

PDF	R脚本	Mineica：基因组数据的独立组件分析
PDF		参考手册

细节

生物浏览	多重组合，，，，软件，，，，可视化
版本	1.37.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（9年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 2.10），方法，生物基因（> = 0.13.8），生物酶，，，，plyr，，，，GGPLOT2，，，，秤，，，，foreach，，，，Xtable，，，，Biomart，，，，gtools，，，，gostats，，，，簇，，，，Marray，，，，mclust，，，，rcolorbrewer，，，，色彩空间，，，，Igraph，，，，rgraphviz，，，，图形，，，，注释，，，，HMISC，，，，Fastica，，，，玉
进口	AnnotationDbi，，，，Lumi，，，，FPC，，，，Lumihumanall.db
链接
建议	Biomart，，，，gostats，，，，簇，，，，HGU133A.DB，，，，mclust，，，，Igraph，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，未来，，，，未来
系统要求
增强	DOMC
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	mineica_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	mineica_1.37.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	mineica_1.37.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mineica
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/mineica
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/mineica/
软件包下载报告	下载统计