MineICA

DOI:10.18129 / B9.bioc.MineICA

对基因组数据进行ICA分解分析

生物导体版本:发布(3.12)

minica的目标是对多个转录组数据集进行独立成分分析(ICA)，整合其他数据(如分子、临床和病理数据)。这种综合ICA通过研究变量(例如样本注释)和基因集的关联，帮助对成分进行生物学解释，并使用基于相关性的图对来自不同数据集的成分进行比较。

作者:安妮Biton

维护者:安妮·比顿<安妮。在gmail.com biton >

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文档

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PDF	R脚本	minica:基因组数据的独立成分分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.10)，方法，BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase,plyr,ggplot2,尺度,foreach,xtable,biomaRt,gtools,GOstats,集群,marray,mclust,RColorBrewer,色彩,igraph,Rgraphviz,图,注释,Hmisc,fastICA,玉
进口	AnnotationDbi,光民,fpc,lumiHumanAll.db
链接
建议	biomaRt,GOstats,集群,hgu133a.db,mclust,igraph,breastCancerMAINZ,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,breastCancerVDX,未来,future.apply
SystemRequirements
增强了	doMC
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MineICA_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	MineICA_1.30.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MineICA_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MineICA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MineICA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MineICA/
包下载报告	下载数据