Interactivecomplexheatmap

doi:10.18129/b9.bioc.bioc.intractivecomplexheatmap

这是发展Interactivecomplexheatmap的版本;对于稳定版本,请参阅Interactivecomplexheatmap

制作互动复杂的热图

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包可以轻松地制作由复杂HeatMap软件包生成的热图中的交互式应用程序。它提供了两种类型的交互式:1。在交互式图形设备上,以及2.在闪亮的应用程序上。它还提供了整合交互式热图小部件的功能,以进行更复杂的闪亮应用程序开发。

作者:Zuguang Gu [AUT,CRE]

维护者:Zuguang gu

引用(从r内,输入引用(“ Interactivecomplexheatmap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel')biocmanager :: InteractivecomplexheatMap”的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ InteractiveComplexHeatMap”)

html R脚本 1.如何互动地可视化热图
html R脚本 2.如何实施交互式复杂热图
html R脚本 3.闪亮应用程序开发的功能
html R脚本 4.热图上的装饰
html R脚本 5.相互作用的热图间接地由Pheatmap(),Heatmap.2()和Heatmap()生成
html R脚本 6.可视化DESEQ2结果的闪亮应用程序
html R脚本 7.从头开始实施交互式热图
html R脚本 8.与合作者分享交互式热图
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.5.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 4.0.0),复杂的图像(> = 2.11.0)
进口 grdevices,统计闪亮的, 网格,getoptlong,,,,S4VECTORS(> = 0.26.1),消化,,,,iranges,,,,KableExtra(> = 1.3.1),utils,svglite,,,,htmltools,,,,clisymbols,,,,jsonlite,,,,rcolorbrewer,,,,fontawesome
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,富集图,,,,基因组机,,,,Data.Table,,,,循环,,,,GenomicFeatures,,,,平淡无奇,,,,tidyheatmap,,,,,,,,org.hs.eg.db,,,,简化,,,,go.db,,,,SC3,,,,goexpress,,,,Singlecellexperiment,,,,评分,,,,GPLOTS,,,,pheatmap,,,,呼吸道,,,,deseq2,,,,DT,,,,可乐,,,,生物管理器,,,,网格文本,,,,Hilbertcurve(> = 1.21.1),发光的dashboard,,,,总结性特征,,,,pkgndep,,,,KS
系统要求
增强
URL https://github.com/jokergoo//interactivecomplexheatmap
BugReports https://github.com/jokergoo//interactivecomplexheatmap/issues
取决于我
进口我
建议我 简化
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Interactivecomplexheatmap_1.5.0.tar.gz
Windows二进制 Interactivecomplexheatmap_1.5.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Interactivecomplexheatmap_1.5.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interactivecomplexheatmap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/Interactivecomplexheatmap
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/interactivecomplexheatmap/
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