Generegionscan

doi：10.18129/b9.bioc.generegionscan

这是发展Generegionscan的版本；对于稳定版本，请参阅Generegionscan。

Generegionscan

生物导体版本：开发（3.16）

专注于分析基因组离散区域的软件包。该软件包对于使用Affymetrix数据研究一个或几个基因很有用，因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级别数据，并将这些数据包装到ProbelevelSet中。probelevelset直接扩展了extressionset，但包括有关每个探针序列及其衍生的探针集的其他信息。该软件包包括许多用于绘制这些探针级别数据作为沿mRNA链序列的位置的函数的功能。这可用于分析可变剪接，并且特别适合与外显子数据数据一起使用。

作者：Lasse Folkersen，迭戈·迪兹

维护者：lasse folkersen

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ generegionscan”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ GenereGionscan”）

PDF	R脚本	Generegionscan
PDF		参考手册

细节

生物浏览	DataImport，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，SNP，，，，软件，，，，可视化
版本	1.53.0
在生物导体中	Bioc 2.4（R-2.9）（13。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	方法，生物酶（> = 2.5.5），生物弦
进口	S4VECTORS（> = 0.9.25），生物酶（> = 2.5.5），affxparser，，，，rcolorbrewer，，，，生物弦
链接
建议	BSGENOME，，，，副词，，，，AnnotationDbi
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	generegionscan_1.53.0.tar.gz
Windows二进制	generegionscan_1.53.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	generegionscan_1.53.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/generegionscan
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/generegionscan
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/generegionscan/
软件包下载报告	下载统计