GenVisR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenVisR

这是发展GenVisR版本;稳定版请参见GenVisR．

基因组可视化R

Bioconductor版本:开发(3.16)

主要在队列水平上为基因组数据制作高度可定制的出版质量图形。

作者:Zachary Skidmore [aut, cre]， Alex Wagner [aut]， Robert Lesurf [aut]， Katie Campbell [aut]， Jason Kunisaki [aut]， Obi Griffith [aut]， Malachi Griffith [aut]

维护者:Zachary Skidmore

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GenVisR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GenVisR”)

超文本标记语言	R脚本	GenVisR:介绍
超文本标记语言	R脚本	可视化小变量
超文本标记语言	R脚本	瀑布:功能介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，DNASeq，DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R(>= 3.3.0)，方法
进口	AnnotationDbi，biomaRt(> = 2.45.8),BiocGenerics，Biostrings，DBIFField,GenomicFeatures，GenomicRanges(> = 1.25.4),ggplot2(> =魅惑,gridExtra(> = 2.0.0),gtable，gtools，IRanges(> = 2.7.5),plyr(> = 1.8.3),reshape2，Rsamtools，尺度，冬青，data.table，BSgenome，GenomeInfoDb，VariantAnnotation
链接
建议	BiocStyle，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，knitr，RMySQL，roxygen2，testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，rmarkdown，vdiffr，formatR，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	GenVisR_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	GenVisR_1.29.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GenVisR_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenVisR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenVisR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GenVisR/
软件包下载报告	下载数据