crisprvariants

doi：10.18129/b9.bioc.crisprvariants

这是发展Crisprvariants的版本；对于稳定版本，请参阅crisprvariants。

计算和可视化目标位置突变的工具

生物导体版本：开发（3.16）

CRISPRVARIANTS提供了分析CRISPR-CAS9诱变测序实验的结果或其他测序实验的工具，在给定区域内的变体中引起了人们的关注。这些工具使用户可以针对任何基因组位置（例如CAS9切割位点），绘制等位基因组合并通过灵活过滤无关变体的灵活过滤来定位变体等位基因组合。

作者：海伦·林赛[AUT，CRE]

维护者：Helen Lindsay

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ crisprvariants”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Crisprvariants”）

PDF	R脚本	crisprvariants
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	CRISPR，，，，datarepresentation，，，，遗传因素，，，，基因组变量，，，，免疫学，，，，软件，，，，变体挖出，，，，可视化
版本	1.25.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.5），GGPLOT2（> = 2.2.0）
进口	AnnotationDbi，，，，生物比较，，，，生物弦， 方法，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，基因组机，grdevices，网格，栅格，，，，iranges，，，，RESHAPE2，，，，rsamtools，，，，S4VECTORS（> = 0.9.38），UTILS
链接
建议	生物使用，，，，gdata，，，，GenomicFeatures，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，rtracklayer，，，，Sangerseqr，，，，测试，，，，变体
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	crisprvariants_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	crisprvariants_1.25.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	crisprvariants_1.25.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprvariants
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/crisprvariants
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/crisprvariants/
软件包下载报告	下载统计