Bionet

doi：10.18129/b9.bioc.bionet

这是发展Bionet的版本；对于稳定版本，请参阅Bionet。

生物网络功能分析的常规

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包为蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测提供了功能。可以通过将统计测试的p值分配给网络节点来集成到网络中。例如。从Affymetrix阵列的基因的差分表达获得的P值分配给网络节点。通过拟合β-均匀的混合模型并计算来自p值的得分，可以计算网络区域的整体得分，并且整数线性编程算法可以识别最大评分子网络。

作者：Marcus Dittrich和Daniela Beisser

维护者：marcus dittrich

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ bionet”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Bionet”）

PDF	R脚本	Bionet教程
PDF		参考手册

细节

生物浏览	DataImport，，，，差异性，，，，基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，软件
版本	1.57.0
在生物导体中	Bioc 2.7（R-2.12）（11。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 2.10.0），图形，，，，rbgl
进口	Igraph（> = 1.0.1），AnnotationDbi，，，，生物酶
链接
建议	RGL，，，，算，，，，DLBCL，，，，GeneFilter，，，，Xtable，，，，全部，，，，林玛，，，，HGU95AV2.DB，，，，XML
系统要求
增强
URL	http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
取决于我
进口我	Smite
建议我	圣诞老人
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Bionet_1.57.0.tar.gz
Windows二进制	bionet_1.57.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Bionet_1.57.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bionet
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/bionet
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/bionet/
软件包下载报告	下载统计