这是发展ArrayExpressHTS版本;稳定的发布版本,请参阅ArrayExpressHTS。
Bioconductor版本:发展(3.16)
公共ArrayExpress RNA-Seq处理管道实验或本地数据集
作者:安琪拉Goncalves,安德鲁Tikhonov
维护人员:安吉拉Goncalves < filimon ebi.ac。英国>,安德鲁Tikhonov <安德鲁在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“ArrayExpressHTS”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ArrayExpressHTS”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ArrayExpressHTS”)
R脚本 | ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.47.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(11年) |
许可证 | 艺术授权2.0 |
取决于 | 抽样,Rsamtools(> = 1.99.0),雪 |
进口 | Biobase,BiocGenerics,Biostrings,GenomicRanges,Hmisc,IRanges(> = 2.13.11),R2HTML,RColorBrewer,Rsamtools,ShortRead,XML,biomaRt,刨边机、grDevices、图形、方法rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailR,bitops |
链接 | Rhtslib(> = 1.15.3) |
建议 | |
SystemRequirements | GNU使 |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ArrayExpressHTS_1.47.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpressHTS |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ArrayExpressHTS |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ArrayExpressHTS/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor