学习R / Bioconductor序列分析

美国旧金山

2015-02-02 ~ 2015-02-03

教练

• 马丁•摩根
• Herve页面

描述

本课程针对初学者和中级用户谁想要介绍分析和理解高通量序列数据使用R和Bioconductor。第一天主要是学习基本的背景知识:R编程语言的介绍;有效使用Bioconductor软件的中心概念;并概述了高通量序列分析的工作流程。第2天的早上强调使用Bioconductor来完成特定的任务，特别是详细研究RNA-seq差异表达的工作流程。第2天的下午将过渡到理解管理更大挑战的有效方法:处理大数据的策略、编写可重用的功能、开发可重复的报告和工作流，以及可视化结果。该课程将授课与广泛的实践结合起来;参加者必须携带一台可以无线上网的笔记本电脑和最新版本的Chrome或Safari网络浏览器。

材料

课程包用于R-3.2。x和Bioconductor 3.1。

为本课程启动Amazon Machine Image (AMI):

• 创建Amazon Web Services (AWS)帐户如果你还没有的话。
• 启动实例ami-ded79ab6;看到文档的。确保你的安全组端口80可访问。
• 将实例的公共DNS名称粘贴到web浏览器中。
• 使用用户名登录RStudio乌本图和密码bioc。
• 一定和终止您的实例当您使用完毕时，以避免过度收费。