Bioc 2014

美国马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌研究所

2014-07-30〜2014-08-01

讲师

• TBA

描述

这次会议强调了生物导体内外的当前发展。早间的科学谈判和下午实践为会议参与者提供了分析和理解高通量基因组数据所需的见解和工具。今年的会议在马萨诸塞州波士顿的Dana-Farber癌症研究所Longwood校园举行。参观会议注册页面了解更多信息。

材料

开发人员节

公共笔记

项目状态

• PDF简介 - 马丁·摩根（Martin Morgan）
• PDF网站，视频，GenomeInfodb -Sonali Arora
• html生物检查，htmlBioc Ami + Starcluster，html颠覆服务器升级-Dan Tenenbaum
• PDFShiny-phyloseq：通过出处跟踪进行交互式微生物组分析的Web应用程序 - Paul Joey McMurdie

讲习班

• html调试R代码。

早上谈话

• pptx通过单细胞分析绘制细胞层次结构 - Guocheng Yuan
• pptx分析癌症基因组的体细胞改变 - 马修·梅尔森（Matthew Meyerson）
• PDF启用基因组数据分析的软件 - 迈克尔·劳伦斯
• PDFR - Kevin Horan中的小分子分子数据的分析
• PDF与RNA-seq数据的灵活分析舞会礼服，Alyssa Frazee
• 介绍epiviz（R）：将基因组浏览器变成交互式显示器 - Hector Corrada Bravo

下午实验室

星期四1:00-2：50

• PDF（幻灯片），PDFr（实验室）R / Bioconductor为每个人 - 马丁·摩根（Martin Morgan）
• html|RMD|r实用和html|RMD|r教程，使用OpencyTo和Bioconductor - Greg Finak的流式细胞仪数据概论
• PDF|RNW|r|数据文件用MinFI软件包 - Kasper Hansen分析450K甲基化数据

• PDF
  r	数据文件

• PDF使用CHIPQC和DIFFBIND软件包对芯片序列的可视化和评估 - 汤姆·卡罗尔（Tom Carroll）

星期四3:10-5：00

• PDF了解如何使用生物导体在高通量测序数据上执行常见任务-HervéPagès
• PDF|html|MD使用EDGER，VOOM和TEARTURECOUNTS - Mark Robinson，对RNA-SEQ数据进行差异基因和外显子级表达分析
• html|RMD|r基因表达的遗传学：计算和综合预测 - Vincent Carey
• html|RMD|r蛋白质组学的R / bioconductor软件包 - Laurent Gatto

• Rpres

  r使用生物通用器 - Levi Waldron对基因组学实验的荟萃分析

星期五1:00-2：50

• PDF|RNW|r使用DESEQ2软件包对RNA-Seq分析 - Michael Love。数据文件：homo_sapiens.grch37.75.subset.gtf.gz采样
• PDF|html|RMD|rCRISPRSEEK：CRISPR-CAS9基因组编辑系统中针对特定目标指南的设计 - 朱莉朱

• html

  RMD

  r

  PDF-背景

  zip-参考

  拉链 - 数字多个'Omics数据集Aedin Culhane的集成途径分析

• 注释工作流程

  AnnotationHub Vignette生物导体注释：使用和共享资源 - Marc Carlson

星期五3:10-5：00

• PDF|r|R-解决方案亚马逊云中使用生物导体的平行计算 - Valerie Obenchain
• PDF|r|PKG使用生物导体的变体呼叫 - 迈克尔·劳伦斯（Michael Lawrence）
• PDF使用CHIPQC和DIFFBIND软件包对芯片序列的可视化和评估 - 汤姆·卡罗尔（Tom Carroll）