rrvgo

DOI:10.18129 / B9.bioc.rrvgo

减少+可视化GO

Bioconductor版本:发行版(3.16)

通过基于语义相似性识别冗余，减少和可视化基因本体术语列表。

作者:Sergi Sayols [aut, cre]

维护者:Sergi Sayols

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rrvgo”)

超文本标记语言	R脚本	使用rrvgo
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	注释，聚类，去，网络，通路，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	GOSemSim，AnnotationDbi，GO.db，pheatmap，ggplot2，ggrepel，treemap，tm，wordcloud，闪亮的， grDevices，网格，统计，方法，umap
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat(> =魅惑,shinydashboard，DT，情节，的热图，magrittr跑龙套,clusterProfiler，剂量，大满贯，org.Ag.eg.db，org.At.tair.db，org.Bt.eg.db，org.Ce.eg.db，org.Cf.eg.db，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.EcK12.eg.db，org.EcSakai.eg.db，org.Gg.eg.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Mmu.eg.db，org.Pt.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Sc.sgd.db，org.Ss.eg.db，org.Xl.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/rrvgohttps://ssayols.github.io/rrvgo/index.html
全靠我
进口我
建议我	genekitr
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	rrvgo_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	rrvgo_1.10.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	rrvgo_1.10.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	rrvgo_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rrvgo
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rrvgo
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rrvgo/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rrvgo/
软件包下载报告	下载数据