CutatedTCGADATA.

DOI：10.18129 / b9.bioc.curatedtcaData.

从癌症基因组Atlas（TCGA）的愈合数据作为MultiAsaySayexperiment对象

Bioconductor版本：释放（3.13）

此包提供来自癌症基因组Atlas（TCGA）的公开数据，作为MultiAsayAayexperiment对象。MultiAssayAdeSexperiment将多种测定（例如，RNA-SEQ，拷贝数，突变，MicroRNA，蛋白等）与临床/病理数据相结合。它还将测定条形码与患者标识符进行链接，从而使整个多族学实验中的行（特征）和列（患者/样本）的统一扩展。

作者：Marcel Ramos [Aut，Cre]，Levi Waldron [CTB]，Lucas Schiffer [CTB]，Ludwig Geistlinger [CTB]，Valerie Obenchain [CTB]，Martin Morgan [CTB]

维护者：Marcel Ramos

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“cutatedtcgadata”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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HTML.	r script.	CutatedTCGADATA.
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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.14.0
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.5.0），MultiAsaySayexperiment.
进口	annotationhub.那实验室那HDF5Array.， 方法，S4Vectors.，统计，概括分析，实用程序
链接到
建议	生物焦那kn那raggedexperiment.那读书那RAMAMAMDOW.那tcgautils.那testthat.
系统要求
加强
URL.
Bugreports.	https://github.com/waldronlab/curatedtcgadata/issues.
取决于我
进口我	amaretto.那Bioconcotk.
建议我	cnvranger.那DCE.那迪科那GLMSParsenet.那netdx.那tcgautils.
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	cutatedtcgadata_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/curatedtcgadata.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ cutatedtcaData
包短网址	https://biocumon.org/packages/curatedtcgadata/
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