HDCytoData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HDCytoData

Bioconductor对象格式的高维细胞检测基准数据集的收集

生物导体版本:发布(3.13)

数据包包含一组公开可用的高维细胞检测基准数据集，格式化为summarizedexperexperimental和flowSet Bioconductor对象格式，包括所有必需的元数据。行元数据包括示例id、组id、患者id、引用单元群或集群标签(如果可用)，以及标识“带刺”单元格(如果可用)的标签。列元数据包括通道名称、蛋白质标记名称和蛋白质标记类(单元类型或单元状态)。

作者:Lukas M. Weber [aut, cre]， Charlotte Soneson [aut]

维护者:Lukas M. Weber

安装

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如果(!2、安装BiocManager::install("HDCytoData")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HDCytoData”)

超文本标记语言	R脚本	1.HDCytoData包
超文本标记语言	R脚本	2.示例和用例
超文本标记语言	R脚本	3.贡献的指导方针
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.11.1
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	ExperimentHub,SummarizedExperiment,flowCore
进口	跑龙套、方法
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,Rtsne,umap,ggplot2,FlowSOM,mclust
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/HDCytoData
BugReports	https://github.com/lmweber/HDCytoData/issues
取决于我	cytofWorkflow
进口我
建议我	diffcyt
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	HDCytoData_1.11.1.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HDCytoData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HDCytoData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HDCytoData/
包下载报告	下载数据