doi:10.18129/b9.bioc.yarn

纱线:强大的多条件RNA-Seq预处理和归一化

生物导体版本:版本(3.12)

使用先前开发的工具组合加快大型RNA-SEQ分析。YARN旨在使用户更容易执行基本的错误保管质量控制,过滤和条件意识的归一化。纱线利用许多生物导体工具和统计技术来解释在非常大的RNA-Seq实验中发现的较大的异质性和稀疏性。

作者:Joseph N Paulson [AUT,CRE],Cho-Yi Chen [aut],Camila Lopes-Ramos [aut],Marieke Kuijjer [aut],John Platig [aut],Abhijeet Sonawane [aut],Maud Fagny [aut],Kimberly Glass [AUT],John Quackenbush [aut]

维护者:Joseph N Paulson

引用(从r内,输入引用(“纱”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ yarn”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“纱”)

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版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶
进口 Biomart,,,,下载器,,,,EDGER,,,,GPLOTS,图形,林玛,,,,矩阵,,,,预处理,,,,readr,,,,rcolorbrewer,统计Quantro
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 0.8)
系统要求
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包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Yarn_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 yarn_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Yarn_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/纱线
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/yarn/
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