生物导体版本:版本(3.12)
使用先前开发的工具组合加快大型RNA-SEQ分析。YARN旨在使用户更容易执行基本的错误保管质量控制,过滤和条件意识的归一化。纱线利用许多生物导体工具和统计技术来解释在非常大的RNA-Seq实验中发现的较大的异质性和稀疏性。
作者:Joseph N Paulson [AUT,CRE],Cho-Yi Chen [aut],Camila Lopes-Ramos [aut],Marieke Kuijjer [aut],John Platig [aut],Abhijeet Sonawane [aut],Maud Fagny [aut],Kimberly Glass [AUT],John Quackenbush [aut]
维护者:Joseph N Paulson
引用(从r内,输入引用(“纱”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ yarn”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“纱”)
R脚本 | 纱线:强大的多组织RNA-seq预处理和归一化 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 生物酶 |
进口 | Biomart,,,,下载器,,,,EDGER,,,,GPLOTS,图形,林玛,,,,矩阵,,,,预处理,,,,readr,,,,rcolorbrewer,统计Quantro |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 0.8) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Yarn_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | yarn_1.16.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Yarn_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/纱线 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/yarn/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体