转录图

doi:10.18129/b9.bioc.Bioc.transcramegremer

基于转录图的转录分析

生物导体版本:版本(3.13)

R包用于转录分析基于转录图,这是一种分析转录组的方法,该转录组在一组有序蛋白上投射表达值的方法排列,使基因产物参与相同代谢途径的概率随着两种蛋白质之间的距离的增加而呈指数降低。订购。因此,转录图是基因组广泛的基因表达谱,可为细胞代谢提供全局视图,同时指示其表达式改变的基因集。

作者:Diego Morais [AUT,CRE],Rodrigo Dalmolin [aut]

维护者:diego morais

引用(从r内,输入引用(“转录图”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ Transcriptcommer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“转录图”)

html R脚本 转录仪用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.4),方法
进口 Biomart,,,,Data.Table,,,,Dosnow,,,,foreach,,,,GGPLOT2,图形,grdevices,Igraph,,,,林玛, 平行,进步,,,,Reder,,,,,统计花花公子,,,,topgo
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行,,,,生物基因
系统要求 Java运行时环境(> = 6)
增强
URL https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer
BugReports https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer/issues
取决于我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Transcriptogramer_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 Transcriptogramer_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Transcriptogramer_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/成绩单图
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/transcriptogramer/
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