pathview

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathview

基于路径的数据集成和可视化工具集

生物导体版本:发布(3.13)

路径视图是一个基于路径的数据集成和可视化工具集。它在相关的通路图上绘制和呈现各种各样的生物数据。所有用户需要的是提供他们的数据并指定目标路径。路径视图自动下载路径图数据，解析数据文件，将用户数据映射到路径，并使用映射的数据呈现路径图。此外，Pathview还与路径和基因集(富集)分析工具无缝集成，实现大规模、全自动的分析。

作者:Weijun罗

维护者:罗伟军<罗伟军在yahoo.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pathview”)

PDF	R脚本	路径视图:基于路径的数据集成和可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	GPL (> = 3.0)
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	KEGGgraph,XML,Rgraphviz,图,png,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,KEGGREST、方法、跑龙套
链接
建议	计,org.Mm.eg.db,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/datapplab/pathviewhttps://pathview.uncc.edu/
取决于我	BioNetStat,EGSEA,RNASeqR,SBGNview
进口我	CompGO,debrowser,EnrichmentBrowser,GDCRNATools,TCGAbiolinksGUI,TCGAWorkflow
建议我	CAGEWorkflow,计,gageData,MAGeCKFlute,TCGAbiolinks
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	pathview_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	pathview_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	pathview_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathview
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pathview
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pathview/
包下载报告	下载数据