pRoloc

DOI:10.18129 / B9.bioc.pRoloc

空间蛋白质组学统一的生物信息学框架

Bioconductor版本:发行版(3.13)

pRoloc包实现了机器学习和可视化方法，用于定量质谱数据的分析和综合，以可靠地推断蛋白质亚细胞定位。

作者:劳伦特·盖托，奥利弗·克鲁克和丽莎·m·布雷克尔斯，托马斯·伯格和塞缪尔·维佐雷克撰稿

维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pRoloc")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pRoloc”)

超文本标记语言	R脚本	空间蛋白质组学的迁移学习算法
超文本标记语言	R脚本	注释空间蛋白质组数据
超文本标记语言	R脚本	贝叶斯空间蛋白质组学与pRoloc
超文本标记语言	R脚本	pRoloc中提供的机器学习技术
超文本标记语言	R脚本	利用pRoloc进行空间蛋白质组学数据分析
PDF		参考手册
文本		新闻
视频		pRoloc, pRolocdata和pRolocGUI

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.32.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)，MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(>= 1.67.10)，方法，Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel
进口	stats4,Biobase，mclust(> = 4.3),脱字符号，e1071，抽样，类，kernlab，晶格，nnet，randomForest，代理，模糊神经网络，hexbin，BiocGenerics统计数据,dendextend，RColorBrewer，尺度，质量，knitr，mvtnorm，LaplacesDemon，coda，mixtools，gtools，plyr，ggplot2，biomaRt， utils, grDevices，图形
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	testthat，rmarkdown，pRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2，xtable，rgl，BiocStyle(> = 2.5.19),hpar(> = 1.15.3),dplyr，akima，字段，素食主义者，GO.db，AnnotationDbi，Rtsne(> = 0.13),nipals，重塑，魔法
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lgatto/pRoloc
BugReports	https://github.com/lgatto/pRoloc/issues
全靠我	pRolocGUI，蛋白质组学
进口我
建议我	MSnbase，pRolocdata，RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	pRoloc_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	pRoloc_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	pRoloc_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pRoloc
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pRoloc
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pRoloc/
软件包下载报告	下载数据