Ensemblvep.

DOI：10.18129 / b9.bioc.ensemblvep.

R接口到Ensembl变体效果预测器

Bioconductor版本：释放（3.13）

通过Perl API查询Ensembl变体效果预测器。

作者：Valerie Obenchain和Lori Shepherd

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“ensemblvep”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“ensemblvep”）

PDF.	r script.	Ensemblvep.
PDF.	r script.	prev90ensemblvep.
PDF.		参考手册
文本		自述
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.34.0
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（8年）
执照	艺术-2.0
依靠	方法，生物根系那Genomicranges.那VariantAnnotation.
进口	S4Vectors.（> = 0.9.25），生物仪器那概括分析那genomeinfodb.，统计数据
链接到
建议	运行
系统要求	Ensembl Vep（API版本104）和Perl模块DBI和DBD :: MySQL必须安装。查看包Readme和Ensembl安装说明：http：//www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_download.html#installer
加强
URL.
取决于我
进口我	mmapp2.那TVTB.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	Ensemblvep_1.34.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	Ensemblvep_1.33.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/ensemblvep.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ ensemblvep
包短网址	https://biocumon.org/packages/ensemblvep/
包裹下载报告	下载统计信息