Rbowtie

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rbowtie

R领结包装

Bioconductor版本:发行版(3.13)

这个包提供了一个围绕流行的领结短读对齐器和SpliceMap的R包装器,SpliceMap是一个全新的拼接结发现和对齐工具。该包由QuasR生物导体包使用。我们建议使用QuasR包而不是直接使用Rbowtie。

作者:Florian Hahne, Anita Lerch, Michael B Stadler

维护者:Michael Stadler < Michael。施在fmi.ch >

引用(从R中,输入引用(“Rbowtie”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“Rbowtie”)

超文本标记语言 R脚本 Rbowtie的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.32.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证 艺术- 2.0 |文件许可证
取决于
进口
链接
建议 testthat平行,BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements GNU使
增强了
URL https://github.com/fmicompbio/Rbowtie
BugReports https://github.com/fmicompbio/Rbowtie/issues
取决于我 QuasR
进口我 MACPETmulticrispr
建议我 eisaR
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 Rbowtie_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 Rbowtie_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) Rbowtie_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbowtie
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rbowtie
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Rbowtie/
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