MSnID

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSnID

LC-MSn蛋白质组学鉴定可信度的探索和评估工具

生物导体版本:发布(3.12)

从mzIdentML(利用mzID包)或文本文件中提取MS/MS ID数据。在整理多个数据集的搜索结果后，评估其识别质量并优化过滤标准，以在不超过指定的错误发现率的情况下实现最大的识别数量。也包含一些实用程序来探索MS/MS结果和评估遗漏和不规则的酶裂解，质量测量的准确性等。

作者:Vlad Petyuk, Laurent Gatto贡献

维护者:Vlad Petyuk < Petyuk at gmail.com>

安装

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如果(!安装BiocManager::install("MSnID")

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文档

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browseVignettes(“MSnID”)

PDF	R脚本	用MSnID处理修改
PDF	R脚本	MSnID处理MS/MS标识包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),Rcpp
进口	MSnbase(> = 1.12.1),mzID(> = 1.3.5),R.cache,foreach,doParallel、并行、方法迭代器,data.table,Biobase,ProtGenerics,reshape2,dplyr,mzR,BiocStyle,msmsTests,ggplot2,RUnit,BiocGenerics,Biostrings,purrr,rlang,stringr,宠物猫,AnnotationHub,AnnotationDbi,xtable
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建议
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增强了
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取决于我	蛋白质组学
进口我
建议我	RforProteomics
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MSnID_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	MSnID_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MSnID_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSnID
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSnID
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSnID/
包下载报告	下载数据