Epivizr.

DOI：10.18129 / b9.bioc.epivizr.

r接口到Epiviz Web App

Bioconductor版本：释放（3.13）

此包提供与Epiviz Web App（http://epiviz.cbcb.umd.edu）的连接，以便进行基因组数据的交互式可视化。R / BIOC交互式会话中的对象可以在基因组浏览器轨道或绘图中显示，通过基因组区域导航探索。支持基本的生物导体数据结构（例如，基因组和范围umarizeMariment对象），同时提供一种容易支持其他数据结构的机制（通过包EPivizrdata）。可视化（使用d3.js）也可以轻松地添加到Web应用程序。

作者：Hector Corada Bravo，Florin Chelaru，Llewellyn Smith，Naomi Goldstein，Jayaram Kancherla，摩根沃尔特，Brian Gottfried

维护者：Hector Corrada Bravo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！qualocamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“Epivizr”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“EPIVIZR”）

HTML.	r script.	Epivizr介绍
PDF.		参考手册
文本		消息
视频		Epiviz快速旅游

细节

Biocviews.	吉伊那基础设施那软件那可视化
版本	2.22.0
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（7.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.0），方法
进口	Epivizrserver（> = 1.1.1），Epivizrdata.（> = 1.3.4），Genomicranges.那S4Vectors.那绞喉那Bumphunter.那Genomeinfodb.
链接到
建议	testthat.那Roxygen2.那kn那BioBase.那概括分析那antiprofilesdata.那hgu133plus2.db.那Mus.Musculus.那生物焦那Minfi.
系统要求
加强
URL.
取决于我	epivizrestalone.
进口我	梅拉维兹尔
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	Epivizr_2.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	Epivizr_2.22.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	Epivizr_2.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/epivizr.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ epivizr
包短网址	https://biocumon.org/packages/epivizr//
包裹下载报告	下载统计信息