RNASEQ123

doi:10.18129/b9.bioc.rnaseq123

这是发展RNASEQ123的版本;对于稳定版本,请参阅RNASEQ123

RNA-seq分析很容易作为1-2-3,具有Limma,Glimma和Edger

生物导体版本:开发(3.16)

R包,支持F1000 Research Workflow的文章,内容涉及Limma,Glimma和Edger的RNA-Seq分析。(2016)。

作者:慈善法律,Monter Alhamdoosh,Shian Su,Xueyi Dong,Luyi Tian,Gordon Smyth和Matthew Ritchie

维护者:Matthew Ritchie

引用(从r内,输入引用(“ RNASEQ123”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel')biocmanager :: install(“ rnaseq123”))

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

BrowseVignettes(“ RNASEQ123”)

html R脚本 为基因表达实验创建设计矩阵的指南(英语版本)
html R脚本 RNA-seq分析很容易作为Limma,Glimma和Edger(中文版)的1-2-3
html R脚本 RNA-seq分析很容易作为Limma,Glimma和Edger(英语版本)的1-2-3

细节

生物浏览 geneexpressionworkflow,,,,Immunooncologyworkflow,,,,工作流程
版本 1.21.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.0),glimma(> = 1.1.9),林玛,,,,EDGER,,,,GPLOTS,,,,rcolorbrewer,,,,mus.musculus,,,,r.utils,,,,Deachertimos,,,,Statmod,,,,BiocworkFlowTools
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://f1000research.com/articles/5-1408/v3
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rnaseq123_1.21.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseq123
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnaseq123
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rnaseq123/
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