RNASEQ123

DOI:10.18129 / b9.bioc.rnaseq123

RNA-SEQ分析易于1-2-3,利用氨纶,光明和edger

Biocometiond版本:释放(3.12)

R包,支持使用Limma,Glimma和Edger对RNA-SEQ分析的F1000Research工作流程文章。(2016)。

作者:慈善法,蒙特尔阿尔汉摩什,珊苏,薛耀东,吕义田,戈登·斯密和马修藤里

维护者:Matthew Ritchie

引文(从R内,输入引文(“rnaseq123”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percenameSpace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“rnaseq123”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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BROWSEVIGNETTES(“RNASEQ123”)

HTML. r script. 创建基因表达实验设计矩阵的指南(英文版)
HTML. r script. RNA-SEQ分析容易为1-2-3,利用Limma,Glimma和Edger(中文版)
HTML. r script. RNA-SEQ分析随着Limma,Glimma和Edger(英文版)容易为1-2-3

细节

Biocviews. GeneexpressionWorkflow.免疫系统工作流程工作流程
版本 1.14.2
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.3.0),光明(> = 1.1.9),林马edger.贡献rcolorbrewer.Mus.Musculus.R.utils.教学编辑Statmod.Biocwoodflowtools.
进口
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.生物焦
系统要求
加强
URL. https://f1000research.com/articles/5-1408/v3.
取决于我
进口我
建议我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 rnaseq123_1.14.2.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13(高塞拉)
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/rnaseq123
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ rnaseq123
包短网址 https://biocumon.org/packages/rnaseq123/
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