Visse

doi：10.18129/b9.bioc.visse

这是发展Visse的版本；对于稳定版本，请参阅Visse。

可视化集合富集分析结果

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包可以使用基于网络和文本挖掘方法对基因集富集分析的结果进行解释和分析。大多数富集分析导致很难解释的重要基因集清单。该软件包中的工具有助于从基因集富集分析中建立一个基于相似性的重要基因集网络，然后可以使用文本挖掘方法对其生物学功能进行研究。

作者：Dharmesh D. Bhuva [AUT，CRE]

维护者：Dharmesh D. Bhuva

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ visse”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ visse”）

html	R脚本	Visse
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，基因烯，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，软件
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1）
进口	Igraph， 方法，plyr，，，，GGPLOT2，，，，Scico，，，，rcolorbrewer，，，，Tm值，，，，GGWORDCLOUD，，，，gseabase，，，，RESHAPE2，grdevices，GGFORCE，，，，MSIGDB，，，，Ggrepel，，，，文本系统，，，，整理图，统计秤，，，，ggraph
链接
建议	测试，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，拼布，，，，唱歌，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Prettydoc，，，，生物使用，，，，pkgdown，，，，COVR
系统要求
增强
URL	https://davislaboratory.github.io/visse
BugReports	https://github.com/davislaboratory/visse/issues
取决于我
进口我
建议我	MSIGDB
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	visse_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	visse_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	visse_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/visse
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/visse
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/visse/
软件包下载报告	下载统计