三轮车

doi：10.18129/b9.bioc.tricycle

这是发展三轮车的版本；对于稳定版本，请参阅三轮车。

三轮车：可转移表示和细胞周期的推断

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包包含使用单细胞RNASEQ数据推断和可视化细胞周期过程的函数。它利用了转移学习的想法，将新数据投射到先前的学习生物学上可解释的空间。我们提供了预学的细胞周期空间，可用于推断人类和小鼠单细胞样品的细胞周期时间。此外，我们还提供功能来可视化不同嵌入和功能上的细胞周期时间以构建新参考。

作者：Shijie Zheng [AUT，CRE]

维护者：shijie Zheng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ tryclecle”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“三轮车”）

html	R脚本	三轮车：可转移表示和细胞周期的推断
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物问题，，，，维度，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录，，，，转录组学
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.0），Singlecellexperiment
进口	方法，圆，，，，GGPLOT2，，，，ggnewscale，，，，AnnotationDbi，，，，评分，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，散点，，，，dplyr，，，，rcolorbrewer，grdevices，统计，总结性特征，UTILS
链接
建议	测试（> = 3.0.0），生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Circstats，，，，牛仔图，，，，htmltools，，，，Seurat，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db
系统要求
增强
URL	https://github.com/hansenlab/tricycle
BugReports	https://github.com/hansenlab/tricycle/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	tricycle_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	tricycle_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	tricycle_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tricycle
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/三轮车
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/tricycle/
软件包下载报告	下载统计