蒂格

doi：10.18129/b9.bioc.tigre

这是发展Tigre的版本；对于稳定版本，请参阅蒂格。

通过高斯过程重建表达的转录因子推断

生物导体版本：开发（3.16）

Tigre软件包实现了我们的高斯过程微分方程模型的方法，用于分析单个输入基序网络的基因表达时间序列。该软件包可用于从已知靶基因的表达测量中推断出未观察到的转录因子（TF）蛋白浓度，或对TF的候选靶标进行排名。

作者：Antti Honkela，Pei Gao，Jonatan Ropponen，Miika-Petteri Matikainen，Magnus Rattray，Neil D. Lawrence

维护者：antti honkela

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ tigre”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Tigre”）

PDF	R脚本	Tigre用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	贝叶斯，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，微阵列，，，，网络引导，，，，软件，，，，时间科，，，，转录
版本	1.51.0
在生物导体中	Bioc 2.6（R-2.11）（12年）
执照	AGPL-3
要看	r（> = 2.11.0），生物基因，，，，生物酶
进口	方法，AnnotationDbi，，，，GPLOTS，图形，grdevices，统计，utils，注释，，，，DBI，，，，rsqlite
链接
建议	drosgenome1.db，，，，彪马，，，，Lumi，，，，生物使用，，，，生物管理器
系统要求
增强
URL	https://github.com/ahonkela/tigre
BugReports	https://github.com/ahonkela/tigre/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	tigre_1.51.0.tar.gz
Windows二进制	tigre_1.51.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	tigre_1.51.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tigre
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/tigre
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/tigre/
软件包下载报告	下载统计