siggenes

doi：10.18129/b9.bioc.siggenes

这是发展Siggenes的版本；对于稳定版本，请参阅siggenes。

使用SAM和EFRON的经验贝叶斯方法进行多次测试

生物导体版本：开发（3.16）

使用微阵列（SAM）的显着性分析和微阵列（EBAM）的经验贝叶斯分析，鉴定出差异表达的基因和错误发现率（FDR）的估计。

作者：Holger Schwender

维护者：Holger Schwender

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ siggenes”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Siggenes”）

html		识别.sam.html
html		plot.ebam.html
html		plot.finda0.html
html		plot.sam.html
html		print.ebam.html
html		print.finda0.html
html		print.sam.html
PDF	R脚本	Siggenes手册
PDF		siggenesrnews.pdf
html		summary.ebam.html
html		summary.sam.html
PDF		参考手册

细节

生物浏览	差异性，，，，exonarray，，，，基因表达，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，SNP，，，，软件
版本	1.71.0
在生物导体中	Bioc 1.6（R-2.1）或更早（> 17年）
执照	LGPL（> = 2）
要看	生物酶，，，，多检验，花键，方法
进口	Stats4，Grdevices，Graphics，Stats，scrime（> = 1.2.5）
链接
建议	副词，，，，注释，，，，GeneFilter，，，，克恩斯门茶
系统要求
增强
URL
取决于我	KCSMART
进口我	coexnet，，，，达帕尔，，，，Desousa2013，，，，Minfi，，，，三人组，，，，XDE
建议我	GCSSCORE，，，，逻辑
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	siggenes_1.71.0.tar.gz
Windows二进制	siggenes_1.71.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	SIGGENES_1.71.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/siggenes
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/siggenes/
软件包下载报告	下载统计