miRNAtap

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRNAtap

这是发展miRNAtap版本;稳定发布版本请参见miRNAtap．

miRNAtap: microRNA目标-聚合预测

Bioconductor版本:开发(3.16)

该软件包促进了需要miRNA预测的工作流程的实现，它允许集成来自多个在线来源的分级miRNA目标预测，并使用各种方法将其聚合，从而提高任何单一来源预测的质量。目前可以对智人、小家鼠和褐家鼠(褐家鼠通过同源翻译)进行预测。

作者:Maciej Pajak, T. Ian Simpson

维护人员:T. Ian Simpson < Ian。辛普森在ed.ac.uk >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("miRNAtap")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“miRNAtap”)

PDF	R脚本	miRNAtap
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，微阵列，测序，软件，microrna的
版本	1.31.0
Bioconductor自	bio 3.0 (R-3.1)(7.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3.0),AnnotationDbi
进口	DBI，RSQLite，stringr，sqldf，plyr、方法
链接
建议	topGOorg.Hs.eg.db miRNAtap.db,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	miRNAtap.db
进口我	SpidermiR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	miRNAtap_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	miRNAtap_1.31.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	miRNAtap_1.31.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRNAtap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRNAtap
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/miRNAtap/
包下载报告	下载数据