miRLAB

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRLAB

这是发展miRLAB版本;稳定发布版本请参见miRLAB

探索miRNA-mRNA关系的干燥实验室

Bioconductor版本:开发(3.16)

提供工具探索miRNA- mrna的关系,包括流行的miRNA靶预测方法,集成方法,整合个别方法,功能从在线资源获取数据,功能验证结果,和功能进行富集分析。

作者:Thuc Duy Le,张俊鹏,陈默,范越煌

维护人员:Thuc Duy Le

引用(从R中,输入引用(“miRLAB”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("miRLAB")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“miRLAB”)

超文本标记语言 R脚本 miRLAB
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression网络NetworkInference软件microrna的
版本 1.27.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口 方法、统计跑龙套,RCurlhttrstringrHmisc能源gplotsglmnet嫁祸于limmapcalgTCGAbiolinksdplyrSummarizedExperimentctcInvariantCausalPrediction类别GOstatsorg.Hs.eg.db
链接
建议 knitrBiocGenericsAnnotationDbiRUnitrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pvvhoang/miRLAB
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 miRLAB_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 miRLAB_1.27.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) miRLAB_1.27.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRLAB
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/miRLAB/
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