Iasva

doi：10.18129/b9.bioc.iasva

这是发展Iasva的版本；对于稳定版本，请参阅Iasva。

迭代调整后的替代变量分析

生物导体版本：开发（3.16）

迭代调整后的替代变量分析（IA-SVA）是一个统计框架，即使这些来源相关，也可以发现隐藏的变化来源。IA-SVA为i）提供了一种灵活的方法，i）在调整所有已知因素的同时，确定一个隐藏的异质性因素；ii）测试假定的隐藏因素对于解释数据中未建模的变化的重要性；iii），如果显着，则将估计因子用作接下来迭代中的附加因素，以发现进一步的隐藏因素。

作者：Donghyung Lee [AUT，CRE]，Anthony Cheng [aut]，Nathan Lawlor [AUT]，Duygu Ucar [aut]

维护者：donghyung lee ，anthony cheng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ iasva”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Iasva”）

html	R脚本	在单细胞RNA-seq数据中检测隐藏的异质性
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	批处理效应，，，，特征提取，，，，免疫学，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL-2
依靠	R（> = 3.5）
进口	irlba，统计簇，图形，总结性特征，，，，生物比较
链接
建议	尼特，，，，测试，，，，rmarkDown，，，，SVA，，，，RTSNE，，，，pheatmap，，，，Corrplot，，，，desctools，，，，rcolorbrewer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	iasva_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	iasva_1.15.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	iasva_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iasva
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/iasva
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/iasva/
软件包下载报告	下载统计