crisprseekplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.crisprseekplus

这是发展crisprseekplus版本;有关稳定发布版本，请参阅crisprseekplus。

crisprseekplus

Bioconductor版本:开发(3.13)

生物信息学平台，包含与offTargetAnalysis和compare2Sequences在CRISPRseek包工作的接口，并指导eqanalysis。

作者:Sophie Wigmore ， Alper Kucukural < Alper。在umassmed.edu kucukural >,Lihua Julie Zhu , Michael Brodsky , Manuel Garber

维护:Alper Kucukural < Alper。在umassmed.edu kucukural >

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.1”)，并输入:

如果(!#初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("crisprseekplus")

对于旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档，启动R并输入:

browseVignettes(“crisprseekplus”)

超文本标记语言	R脚本	DEBrowser装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneRegulation,SequenceMatching,软件
版本	1.17.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.3.0),闪亮的,shinyjs,CRISPRseek
进口	DT跑龙套,GUIDEseq,GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocManager,BSgenome,AnnotationDbi,哈希
链接
建议	testthat,rmarkdown,knitr,R.rsp
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus
BugReports	https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus/issues/new
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循安装在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	crisprseekplus_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	crisprseekplus_1.17.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	crisprseekplus_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprseekplus
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ crisprseekplus
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/crisprseekplus/
包下载报告	下载数据