细胞

doi:10.18129/b9.bioc.cellity

这是发展单元的版本;对于稳定版本,请参阅细胞

单细胞RNA-seq数据的质量控制

生物导体版本:开发(3.16)

从单细胞RNA-seq数据集中识别和过滤低质量单元的支持向量机方法。

作者:Tomislav Illicic,Davis McCarthy

维护者:tomislav iLicic

引用(从r内,输入引用(“细胞”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ cellity”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“单元”)

html R脚本 单元包的介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 维度,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,辅助视摩钦,,,,转录组学,,,,可视化
版本 1.25.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.3)
进口 AnnotationDbi,,,,E1071,,,,GGPLOT2,图形,grdevices,网格,mvoutlier,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,鲁棒,统计topgo,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,商在,,,,尼特,,,,测试,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Cellity_1.25.0.tar.gz
Windows二进制 Cellity_1.25.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) Cellity_1.25.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellity
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/单元
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cellity/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户