bioassayR

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioassayR

这是发展bioassayR版本;稳定的发布版本请参见bioassayR．

小分子生物活性的交叉靶点分析

生物导体版本:开发(3.14)

bioassayR是一个计算工具，可以同时分析数千个生物分析实验执行的不同的化合物和生物目标。独特的功能包括支持公共和自定义生物分析的大规模跨目标分析，高通量筛选指纹(HTSFPs)的生成，以及可选的预加载数据库，提供对大量公共可用的生物活性数据的访问。

作者:Tyler Backman, Ronly Schlenk, Thomas Girke

维护者:Daniela Cassol

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("bioassayR")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“bioassayR”)

超文本标记语言	R脚本	生物测定法简介和实例
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，CellBasedAssays，DataImport，ImmunoOncology，基础设施，代谢组学，MicrotitrePlateAssay，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.31.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),DBI(> = 0.3.1),RSQLite(> = 1.0.0)、方法矩阵，rjson，BiocGenerics(> = 0.13.8)
进口	XML，ChemmineR
链接
建议	BiocStyle，RCurl，biomaRt，cellHTS2，knitr，knitcitations，knitrBootstrap，testthat，ggplot2，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/girke-lab/bioassayR
BugReports	https://github.com/girke-lab/bioassayR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	bioassayR_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	bioassayR_1.31.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	bioassayR_1.31.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioassayR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bioassayR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bioassayR/
包下载报告	下载数据