tnbc.cms

doi:10.18129/b9.bioc.tnbc.cms

这是发展tnbc.cms的版本;对于稳定版本,请参阅tnbc.cms

TNBC.CMS:TNBC共识分子亚型的预测

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包实现了基于机器学习的分类器,以分配分子亚型为TNBC样品。它还提供了总结基因组和临床特征的功能。

作者:Doyeong Yu,Jihyun Kim,位于Hae Park,Charny Park

维护者:doyeong yu

引用(从r内,输入引用(“ tnbc.cms”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(sentern(version ='devel')biocmanager :: install(“ tnbc.cms)”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ tnbc.cms”)

PDF R脚本 tnbc.cms.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,基因表达,,,,遗传,,,,软件,,,,辅助视摩钦
版本 1.13.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3.5岁)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.6.0),E1071,,,,Quadprog,,,,总结性特征
进口 GSVA(> = 1.26.0),pheatmap,grdevices,rcolorbrewer,,,,pracma,,,,ggally,,,,r.utils,,,,森林图,,,,GGPLOT2,,,,ggpubr,,,,生存,网格,统计,方法
链接
建议 尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tnbc.cms_1.13.0.tar.gz
Windows二进制 tnbc.cms_1.13.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) tnbc.cms_1.13.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tnbc.cms
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tnbc.cms
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tnbc.cms/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户