R3CPET

DOI:10.18129 / B9.bioc.R3CPET

这是发展R3CPET版本;稳定的发布版本,请参阅R3CPET。

3 cpet:找到辅助因子复合物在Chia-PET实验中使用分层狄利克雷的过程

Bioconductor版本:发展(3.16)

包提供了一组方法来推断的蛋白质更可能共同维护chormatin交互ChIA-PET实验结果。

作者:杨Djekidel MN, Chen等人。

维护人员:穆罕默德Nadhir Djekidel < djek。nad gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“R3CPET”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“R3CPET”)

PDF	R脚本	3 cpet:找到辅助因子复合物保持Chia-PET交互
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,GenePrediction,GraphAndNetwork,嗝,网络,NetworkInference,软件
版本	1.29.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(7年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2),Rcpp(> = 0.10.4)方法
进口	方法、并行ggplot2,pheatmap,clValid,igraph,data.table,reshape2,Hmisc,RCurl,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.31.8),ggbio
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,knitr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,biovizBase,biomaRt,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,闪亮的,ChIPpeakAnno
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sirusb/R3CPET/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	R3CPET_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	R3CPET_1.29.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	R3CPET_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R3CPET
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ R3CPET
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/R3CPET/
包下载报告	下载数据