phosr

doi：10.18129/b9.bioc.phosr

这是发展Phosr的版本；对于稳定版本，请参阅phosr。

一组用于全面分析磷蛋白质组学数据的方法和工具

生物导体版本：开发（3.16）

PHOSR是用于磷酸蛋白质组学数据的综合分析的包装。PHOSR有两个主要组成部分：处理和下游分析。PHOSR由用于磷酸蛋白质组学数据的各种处理工具组成，包括过滤，插补，归一化和用于推断活性激酶和信号通路的功能分析。

作者：Pengyi Yang [Aut]，Taiyun Kim [AUT，CRE]，Hani Jieun Kim [aut]

维护者：taiyun kim

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ phosr”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ phosr”）

html	R脚本	PHOSR包装介绍
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	蛋白质组学，，，，研究菲尔德，，，，软件
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	R（> = 4.1.0）
进口	鲁夫，，，，E1071，，，，Dendextend，，，，林玛，，，，pcamethods，统计rcolorbrewer，，，，循环，，，，dplyr，，，，Igraph，，，，pheatmap，，，，预处理，，，，花花公子，，，，rlang，图形，grdevices，utils，总结性特征， 方法，S4VECTORS，，，，生物基因，，，，GGPLOT2，，，，ggally，，，，ggdendro，，，，ggpubr，，，，网络，，，，RESHAPE2，，，，ggtext
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，RGL，，，，sna，，，，克劳尔，，，，Directpa，，，，rmarkDown，org.rn.eg.db，org.mm.eg.db，reactome.db，注释，，，，生物使用，，，，Stringr，，，，校准
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	phosr_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	phosr_1.7.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	phosr_1.7.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phosr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/phosr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/phosr/
软件包下载报告	下载统计