NanostringQccpro

doi：10.18129/b9.bioc.nanostringqccpro

这是发展nanostringqccpro的版本;对于稳定版本，请参阅NanostringQccpro。

纳米串mRNA基因表达数据的质量指标和数据处理方法

生物导体版本：开发（3.16）

NanoStringQCPRO提供了一组质量指标，可用于评估纳米串mRNA基因表达数据的质量 - 即确定离群探针和离群样品。它还为该数据提供了不同的背景减法和归一化方法。它输出了标记样品/探针和易于共享的HTML质量控制输出的建议。

作者：dorothee nickles ，托马斯·桑德曼（Thomas Sandmann

维护者：Robert Ziman

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version（version ='devel'）biocmanager :: install（nanoStringQcccpro“）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ nanostringqcpro”）

PDF		vignettenanostringqccpro.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	微阵列，，，，正常化，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，报告写作，，，，软件，，，，Mrnamicroarray
版本	1.29.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.2），方法
进口	AnnotationDbi（> = 1.26.0），org.hs.eg.db（> = 2.14.0），生物酶（> = 2.24.0），尼特（> = 1.12），NMF（> = 0.20.5），rcolorbrewer（> = 1.0-5），PNG（> = 0.1-7）
链接
建议	roxygen2（> = 4.0.1），测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nanostringqccpro_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	nanostringqccpro_1.29.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	nanostringqccpro_1.29.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanostringqccpro
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/nanostringqccpro
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nanostringqcpro/
软件包下载报告	下载统计