纳米塞维兹

doi：10.18129/b9.bioc.nanomethviz

这是发展纳米塞维兹的版本;对于稳定版本，请参阅纳米塞维兹。

可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据

生物导体版本：开发（3.16）

纳米塞维兹（NanoMethviz）是一种用于可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据的工具包。它可用于探索来自牛津纳米孔直接DNA测序的读物的甲基化模式，并由包括纳米波利斯，F5C和Megalodon在内的呼叫者称为甲基化。该软件包中的图允许可视化实验组和基因组特征类别汇总的甲基化谱。

作者：Shian Su [Cre，Aut]

维护者：shian su

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ nanomethviz”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“纳米塞维兹”）

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html	R脚本	导入/导出数据
html	R脚本	介绍
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文本		消息

细节

生物浏览	差甲基化，，，，软件，，，，可视化
版本	2.3.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	Apache许可证（> = 2.0）
要看	R（> = 4.0.0），方法，GGPLOT2
进口	CPP11（> = 0.2.5），readr，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，生物兴奋，，，，BSSEQ，，，，福卡，，，，断言，，，，AnnotationDbi，，，，RCPP，，，，dplyr，，，，Data.Table，，，，E1071，，，，FS，，，，基因组机，，，，胶水，，，，林玛（> = 3.44.0），拼布，，，，purrr，，，，rlang，，，，rsqlite，，，，rsamtools，，，，秤，，，，Scico，统计Stringr，，，，蒂布尔，，，，花花公子，utils，用，，，，Zlibbioc
链接	RCPP
建议	DSS，，，，mus.musculus，，，，同性恋，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试（> = 3.0.0），COVR
系统要求	C ++ 11
增强
URL	https://github.com/shians/nanomethviz
BugReports	https://github.com/shians/nanomethviz/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nanomethviz_2.3.0.tar.gz
Windows二进制	nanomethviz_2.3.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	nanomethviz_2.3.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanomethviz
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/nanomethviz
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nanomethviz/
软件包下载报告	下载统计