Gsreg.

DOI：10.18129 / b9.bioc.gsreg.

这是发展GSREG的版本;对于稳定的版本版本，请参阅Gsreg.。

基因设定规则（GS-REG）

Bioconductor版本：开发（3.13）

基于表达式的基因集分析的包装以及检测替代拼接事件的方法。它实现差分级别保护（DIRAC）和基因设置表达变异分析（EVA）方法。为了检测差异拼接基因，它提供了剪接EVA（SEVA）的实现。

作者：Bahman Afsari ，Elana J. Fertig

维护者：Bahman Afsari ，Jhmi.edu的Elana J. Fertig

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（版本='devel'）biocmanager ::安装（“gsreg”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“GSREG”）

PDF.	r script.	使用GSREG包
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	替代品那基因表达那Generegulation.那GenesetenRichment.那遗传性那途径那软件
版本	1.25.0
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（6.5岁）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 2.13.1），homo.sapiens.那org.hs.eg.db.那基因组法那annotationdbi.
进口
链接到
建议	Genomicranges.那Gsbenchmark.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随安装在r会话中使用此包的说明。

源包	gsreg_1.25.0.tar.gz.
Windows二进制文件	gsreg_1.25.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	gsreg_1.25.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/gsreg.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包/ gsreg
包短网址	https://biocumon.org/packages/gsreg/
包裹下载报告	下载统计信息