ga4ghshiny

doi:10.18129/b9.bioc.ga4ghshiny

这是发展Ga4ghshiny的版本;对于稳定版本,请参阅ga4ghshiny

与基于GA4GH的数据服务器交互的闪亮应用

生物导体版本:开发(3.16)

GA4GHSHINY软件包提供了一种基于全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API与数据服务器进行交互的简便方法。它还与信标网络集成。

作者:Welliton Souza [AUT,CRE],Benilton Carvalho [CTB],Cristiane Rocha [CTB],Elizabeth Borgognoni [CTB]

维护者:welliton souza

引用(从r内,输入引用(“ ga4ghshiny”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ ga4ghshiny”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ga4ghshiny”)

html R脚本 ga4ghshiny
PDF 参考手册

细节

生物浏览 GUI,,,,软件
版本 1.19.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 ga4ghclient
进口 AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,dplyr,,,,DT,,,,GenomeInfodB,,,,OpenXLSX,,,,GenomicFeatures, 方法,purrr,,,,S4VECTORS,,,,闪亮的,,,,Shinyjs,,,,花花公子,,,,有光泽的人
链接
建议 生物使用,,,,org.hs.eg.db,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/labbcb/ga4ghshiny
BugReports https://github.com/labbcb/ga4ghshiny/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ga4ghshiny_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 ga4ghshiny_1.19.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) ga4ghshiny_1.19.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ga4ghshiny
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ga4ghshiny
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ga4ghshiny/
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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户