FCBF

DOI:10.18129 / B9.bioc.FCBF

这是发展FCBF版本;稳定版请参见FCBF

基于快速相关的特征选择滤波器

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个包为Yu, L.和Liu, H.描述的基于快速相关的过滤器提供了一个简单的R实现;高维数据特征选择:一种基于快速相关的滤波解决方案。20 Intl。相依马赫。学习。(ICML-2003),华盛顿DC, 2003当前的软件包旨在使生物信息学家更容易地使用FCBF进行特征选择,特别是关于转录组数据。这意味着在计算解释类的特征(但不能被其他特征预测)之前离散表达式(function discretize_exprs)。这些函数是基于Yu和Liu, 2003的算法和Rajarshi Guha从2005年5月13日(截至2018年8月26日)在http://www.rguha.net/code/R/fcbf.R上实现的。

作者:Tiago Lubiana [aut, cre], Helder Nakaya [aut, ths]

维护者:Tiago Lubiana < Tiago . Lubiana。阿尔维斯在usp.br>

引文(从R内,输入引用(“FCBF”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("FCBF")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“FCBF”)

超文本标记语言 R脚本 FCBF:基于快速相关的特征选择滤波器
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 分类FeatureExtractionGeneExpressionGeneTargetImmunoOncologySingleCell软件
版本 2.5.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.1)
进口 ggplot2gridExtrapbapply平行,SummarizedExperiment统计数据,mclust
链接
建议 脱字符号mlbenchSingleCellExperimentknitrrmarkdowntestthatBiocManager
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 fcoex
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 FCBF_2.5.0.tar.gz
Windows二进制 FCBF_2.5.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) FCBF_2.5.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FCBF
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FCBF
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/FCBF/
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