阿斯普利

doi:10.18129/b9.bioc.aspli

这是发展Aspli的版本;对于稳定版本,请参阅阿斯普利

使用RNA-Seq分析替代剪接

生物导体版本:开发(3.16)

用于使用RNASEQ分析替代剪接的集成管道。

作者:Estefania Mancini,Andres Rabinovich,Javier Iserte,Marcelo Yanovsky和Ariel Chernomoretz

维护者:estefania mancini

引用(从r内,输入引用(“ aspli”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ aspli”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ aspli”)

PDF R脚本 阿斯普利
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,替代方案,,,,覆盖范围,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,基因数,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,时间科,,,,转录
版本 2.7.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 GPL
要看 方法,grdevices,统计,utils,并行,EDGER,,,,林玛,,,,AnnotationDbi
进口 基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,生物基因,,,,iranges,,,,基因组签名,,,,GVIZ,,,,S4VECTORS,,,,rsamtools,,,,生物使用,,,,Igraph,,,,htmltools,,,,Data.Table,,,,insctr,,,,花花公子,,,,DT,,,,大量的,网格,图形,pbmcapply
链接
建议
系统要求
增强
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取决于我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 aspli_2.7.0.tar.gz
Windows二进制 aspli_2.7.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) aspli_2.7.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aspli
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/aspli
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/aspli/
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