apeglm

DOI:10.18129 / B9.bioc.apeglm

GLM系数的近似后验估计

Bioconductor版本:发布(3.15)

apeglm为各种GLM模型的效应大小提供贝叶斯收缩估计，使用对单个系数的后验近似。

作者:朱安琪[aut, cre]， Joshua Zitovsky [ctb]， Joseph Ibrahim [aut]， Michael Love [aut]

维护者:anqizhu

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("apeglm")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“apeglm”)

超文本标记语言	R脚本	用apeglm估计效应量
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor中	BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	emdbook，SummarizedExperiment，GenomicRanges，方法，统计，utils，Rcpp
链接	Rcpp，RcppEigen，RcppNumerical
建议	DESeq2，气道，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	rnaseqGene
进口我	airpart，debrowser，DiffBind，TEKRABber
建议我	bambu，BRGenomics，DESeq2，鱼池，NanoporeRNASeq
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	apeglm_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	apeglm_1.18.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	apeglm_1.18.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apeglm
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/apeglm
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/apeglm/
软件包下载报告	下载数据