Rhtslib

doi：10.18129/b9.bioc.rhtslib

HTSLIB高通量测序库作为R包

生物导体版本：版本（3.15）

该软件包提供了“ HTSLIB” C库的1.7版，用于高通量序列分析。该软件包主要对希望使用HTSLIB的其他R软件包的开发人员有用。2021欧洲杯体育投注开户使用此软件包的动机和说明在Vignette，Vignette（软件包=“ Rhtslib”，“ Rhtslib”）中。

作者：纳撒尼尔·海登（Nathaniel Hayden

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ rhtslib”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Rhtslib”）

html	R脚本	Rhtslib的动机和使用
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，测序，，，，软件
版本	1.28.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7。5年）
执照	LGPL（> = 2）
要看
进口	Zlibbioc
链接	Zlibbioc
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用
系统要求	libbz2＆liblzma＆libcurl（带有标题文件），GNU制作
增强
URL	//www.andersvercelli.com/packages/rhtslibhttp://www.htslib.org/
BugReports	https://github.com/bioconductor/rhtslib/issues
取决于我
进口我	Deepsnv，，，，Diffhic，，，，maftools，，，，线粒体2，，，，scpipe
建议我
链接到我	arrayexpresshts，，，，bamsignals，，，，bitseq，，，，CSAW，，，，Deepsnv，，，，差异，，，，Diffhic，，，，Epialleler，，，，火焰，，，，H5VC，，，，maftools，，，，甲基库，，，，线粒体2，，，，podkat，，，，QRQC，，，，准，，，，RFASTP，，，，rsamtools，，，，scpipe，，，，seqbias，，，，Shortread，，，，transview，，，，变体
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rhtslib_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	rhtslib_1.28.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	rhtslib_1.28.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhtslib
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rhtslib
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rhtslib/
软件包下载报告	下载统计