罗斯

doi：10.18129/b9.bioc.roseq

建模表达式排名scrna-seq数据的耐噪声差分表达分析

生物导体版本：版本（3.15）

ROSEQ-一种基于秩的方法，用过滤和归一化读取计数矩阵建模基因表达。Roseq将过滤和归一化的读取矩阵和细胞拨入/条件作为输入，并确定单细胞对比组之间的差异表达基因。输入参数之一是要使用的核心数。

作者：Krishan Gupta [AUT，CRE]，Manan Lalit [aut]，Aditya Biswas [aut]，Abhik Ghosh [aut]，Debarka Sengupta [aut]

维护者：Krishan Gupta

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Roseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Roseq”）

html	R脚本	罗斯
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0）
进口	pbmcapply，，，，EDGER，，，，林玛
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，运行，，，，生物基因
系统要求
增强
URL	https://github.com/krishan57gupta/roseq
BugReports	https://github.com/krishan57gupta/roseq/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ROSEQ_1.8.0.TAR.GZ
Windows二进制	roseq_1.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ROSEQ_1.8.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/roseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/roseq/
软件包下载报告	下载统计