ROSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.ROSeq

scRNA-Seq数据的耐噪声差异表达分析的表达等级建模

Bioconductor版本:发行版(3.16)

ROSeq -一种基于秩的方法来建模基因表达过滤和标准化的读计数矩阵。ROSeq以过滤后归一化的read matrix和cell-annotation/condition作为输入，确定对比组单细胞之间的差异表达基因。其中一个输入参数是要使用的核数。

作者:Krishan Gupta [aut, cre]， Manan Lalit [aut]， Aditya Biswas [aut]， Abhik Ghosh [aut]， Debarka Sengupta [aut]

维护者:Krishan Gupta

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ROSeq”)

超文本标记语言	R脚本	ROSeq
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，SingleCell，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	pbmcapply，刨边机，limma
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/krishan57gupta/ROSeq
BugReports	https://github.com/krishan57gupta/ROSeq/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ROSeq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ROSeq_1.10.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ROSeq_1.10.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ROSeq_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ROSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ROSeq
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ROSeq/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ROSeq/
软件包下载报告	下载数据