Cellnoptr

doi：10.18129/b9.bioc.cellnoptr

使用先验知识网络和扰动数据培训信号网络的布尔逻辑模型

生物导体版本：版本（3.15）

该软件包可以根据先前的知识网络和网络中节点扰动的一组数据来优化信号通路的布尔逻辑网络。

作者：Thomas Cokelaer [aut]，Federica Eduati [AUT]，Aidan MacNamara [AUT]，S Schrier [CTB]，Camille Terfve [AUT]，Enio Gjerga [CTB]，Attila Gabor [CRE]

维护者：attila gabor

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ CellNoptr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ cellnoptr”）

html	R脚本	使用先验知识网络和使用CellNoptr的扰动数据培训信号网络的布尔逻辑模型
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	蜂窝基，，，，细胞生物学，，，，免疫学，，，，网络，，，，途径，，，，蛋白质组学，，，，软件，，，，时间科
版本	1.42.1
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（10。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.0.0），rbgl，，，，图形， 方法，rcurl，，，，rgraphviz，，，，XML，，，，GGPLOT2，，，，rmarkDown
进口	Igraph，，，，Stringi，，，，Stringr
链接
建议	Data.Table，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，readr，，，，尼特，，，，运行，，，，生物基因
系统要求	GraphViz版本> = 2.2
增强	多帕尔，，，，foreach
URL
取决于我	CNORDT，，，，cnorfeeder，，，，cnorfuzzy，，，，cnorode
进口我	Bnem
建议我	Meigor
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cellnoptr_1.42.1.tar.gz
Windows二进制	cellnoptr_1.42.1.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	cellnoptr_1.42.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellnoptr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cellnoptr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cellnoptr/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档