BEARscc

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEARscc

单细胞簇稳健性的贝叶斯ERCC评估

Bioconductor版本:发布(3.15)

BEARscc是一种噪声估计和注射工具，用于在ERCC峰值控制估计的实验噪声背景下评估假定的单细胞RNA-seq簇。

作者:David T. Severson

维护者:Benjamin Schuster-Boeckler < Benjamin。Schuster-boeckler网址:ludwig.ox.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BEARscc")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BEARscc”)

PDF	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，ImmunoOncology，SingleCell，软件，转录组
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	ggplot2，SingleCellExperiment，data.table，统计，utils，图形，编译器
链接
建议	testthat，cowplot，knitr，rmarkdown，BiocStyle，NMF
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BEARscc_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	BEARscc_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BEARscc_1.16.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BEARscc
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/BEARscc
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BEARscc/
软件包下载报告	下载数据